Imagen microscópica del intestino anterior.
Crédito: Rocha Lab, NICHD
Los genes suelen visualizarse como largas cadenas muy organizadas dentro del núcleo celular, con mecanismos que ayudan a plegar, compactar y desplegar áreas según sea necesario para dirigir el crecimiento, la función y el desarrollo celular.
Los bucles de ADN creados por la proteína CTCF son un tipo de mecanismo regulador. Estos bucles crean límites físicos entre los potenciadores (ADN no codificante que ayuda a fomentar la actividad o transcripción de los genes) y las zonas de los genes donde comienza la transcripción, que se conocen como promotores. Por razones poco claras, la CTFC puede actuar fuertemente para reprimir la actividad génica en ciertos tipos de tejidos y no en otros.
En un reciente estudio con ratones realizado por el Laboratorio Rocha 
, los investigadores exploraron este fenómeno definiendo los contextos que permiten que algunas interacciones potenciador-promotor eludan los bucles mediados por CTCF . Descubrieron que los bucles de CTCF pueden interferir en la expresión del gen Sox2, el cual es esencial para el desarrollo embrionario, en el intestino anterior, precursor de los pulmones, la tráquea, el esófago y el estómago. No obstante, el equipo también observó que CTCF no reprimía la activación de Sox2 en el epiblasto y los tejidos neurales. Los autores proponen que los grupos de potenciadores con una alta densidad de actividad reguladora pueden superar mejor las barreras físicas para mantener una expresión génica fiel y una robustez fenotípica. Este trabajo también aparece en el NIH Catalyst .
Obtenga más información sobre el Grupo de Afinidad de Genética y Epigenética del Desarrollo:
https://www.nichd.nih.gov/about/org/dir/affinity-groups/GED .
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